Kode SB · 4 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Surabaya Kota dilalui 4 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Commuter Line Dhoho | #35 | 09:05 | — |
| Commuter Line Supas | #1 | — | 02:00 |
| Parcel Selatan | #107 | 08:23 | — |
| Sri Tanjung | #46 | 12:30 | 13:15 |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.