Kode POK · 17 kereta melintasi stasiun ini.
Ringkas: Stasiun Pondok Jati dilalui 17 kereta menurut GAPEKA. Berikut daftar kereta beserta posisi perhentian (seq) pada stasiun ini.
| Kereta | Urutan | Tiba | Berangkat |
|---|---|---|---|
| Bogowonto | #75 | — | — |
| Fajar Utama Solo | #4 | — | — |
| Fajar Utama Yk | #74 | — | — |
| Gajahwong | #4 | — | — |
| Jaka Tingkir | #4 | — | — |
| Jayakarta | #119 | — | — |
| Kertajaya | #4 | — | — |
| Madiun Jaya | #97 | — | — |
| Majapahit | #4 | — | — |
| Mataram | #84 | — | — |
| Menoreh | #59 | — | — |
| Progo | #75 | — | — |
| Sawunggalih | #66 | — | — |
| Senja Utama Solo | #84 | — | — |
| Senja Utama Yk | #75 | — | — |
| Tawang Jaya | #58 | — | — |
| Tawangjaya Premium | #4 | — | — |
Urutan (#) menunjukkan posisi perhentian kereta tersebut pada stasiun ini di sepanjang rute.